Actividades Docentes

• Pregrado: Principios de Genética Humana (ICML 110, responsable), Genética y Embriología Humana (ICML 151), Biología Celular y Genética (ICML 060, claborador), Biología del Desarrollo (ICML 205, responsable), Evolución Orgánica (ECEV 222, colaborador), Biomedicina (HIPA 206, colaborador), Seminarios de Investigación y Bibliográficos, Talleres y Tesis de Titulación.
• Postgrado: Microscopía Teórica y práctica en Biología Celular (BIMI 410, colaborador), Tópicos experimentales de Genómica (BIOQ 361, colaborador), Estrategias experimentales de expresión génica en teleósteos (BIOQ 362, colaborador), Biología Celular y Molecular en Biomedicina (HIPA 430, colaborador), Seminarios de Investigación y Bibliográficos, Tesis.

Intereses de investigación

a) Morfogénesis Animal in vivo:

•  Movimientos celulares colectivos.
•  División celular.
• Adhesión celular.
• Uso de metodologías cuantitativas en mircoscopía confocal.
• Embriogénesis a nivel mesoscópico.
• Genética del desarrollo animal.

¿Cómo la conducta celular colectiva es capaz de formar complejos tejidos y órganos en tres dimensiones bajo una forma y tamaño bien definida? ¿ Qué principios celulares, genéticos y biofísicos regulan este complejo fenómeno?. Nuestro laboratorio esta centrado en entender los mecanismos celulares y moleculares durante la embriogénesis de tejidos animales. Para ello, estudiamos el proceso de la neurulación en vertebrados, utilizando el embrión de pez cebra (Danio rerio) como modelo animal. Debido a su rápido desarrollo generacional, gran disponibilidad de embriones por puesta, amplia gama de herramientas genéticas, y la insuperable transparencia de sus embriones y larvas hacen del pez cebra, un sistema ideal para la entender las bases celulares y moleculares de la embriogénesis. Aprovechando estas propiedades, nuestro laboratorio utiliza una combinación de herramientas genéticas, uso de modernas técnicas de visualización (microscopía confocal) y cuantificación (herramientas computacionales para el procesameinto de imágenes) a fin de extraer principios fundamentales que  gobiernan este proceso morfogenético.
 

Proyectos de investigación

• DID-UACh. S-2016-13. Visualizing ECM function during live tissue morphogenesis (2016-2018). Investigador Principal.
• Conicyt-ECOS (Chile-France) C13B03. Integration tissue forces during vertebrate epithelial invagination”, Dr Claudio Araya (Chile)-Nadine Peyrieras (Francia).  Investigador principal (2014-2016). 
• FONDECYT 1110106. nvestigating in vivo cell and tissue dynamics during vertebrate neuroepithelial morphogenesis. Investigador principal (2011-2014).

Publicaciones

• Araya, C., Häkkinen, H.M., Carcamo, L., Cerda, M., Savy, T., Peyriéras, N., Rookyard, C., and Clarke, J.D.W. 2019. Cdh2 coordinates Myosin-II dependent internalisation of the zebrafish neural plate. Scientific Reports, 12;9(1):1835.
• Alarcón, C., Inostroza, M., Torres, C., Araya, C., Miranda, M., Sánchez, J.C., Moreno-Villoslada, I., and Oyarzun- Ampuero, F. 2018. Protection of astaxanthin from photodegradation by its inclusion in hierarchically assembled nano and microstructures with potential as food. Food Hydrocolloids, 83, 36-44.
• Araya, C., Carmona-Fontaine, C., and Clarke, J.D.W. 2016. ECM couples the convergence movements of mesoderm and neural plate during the early stages of neurulation. Developmental Dynamics, 245, 580-589.
• Araya, C., Ward, L., Girdler, G., and Miranda, M. 2016. Coordinating cell and tissue behavior during zebrafish neural tuve morphogenesis. Developmental Dynamics, 245, 197-208.
• Araya, C., Tawk, M., Costa, M., Girdler, G., Carmona-Fontaine, C., and Clarke, J. 2014. Mesoderm is required for coordinated convergence movements of the zebrafish neural plate in vivo. Neural Development, 9: 6-15.
• Girdler, G.C., Araya, C., Ren, X.Y., and Clarke, J.D.W. 2013. Developmental time rather than local environment regulates the schedule of epithelial polarization in the zebrafish neural rod. Neural Development, 8: 5-13.
• Buckley, C.E., Ren, X.Y., Araya, C., Green, M.J., Clark, B.S., Link, B.A., and Clarke, J.D.W. 2013. Mirror-symmetric microtubule assembly and cell interactions drive lumen formation in the zebrafish neural rod. EMBO Journal, 32(1): 30-44.
• Steventon, B., Araya, C., Linker, C., Kuriyama, S., and Mayor, R. 2009. Differential requirements of BMP and Wnt signalling during gastrulation and neurulation define two steps in neural crest induction. Development, 136(5): 771-779.
• Tawk, M., Araya, C., Lyons, D.A., Reugels, A.M., Girdler, G.C., Bayley, P.R., Hyde, D.R., Tada, M., and Clarke, J.D.W. 2007. A mirror-symmetric cell division that orchestrates neuroepithelial morphogenesis. Nature, 446(7137): 797-800.
• De Calisto, J., Araya, C., Marchant, L., Riaz, C.F., and Mayor, R. 2005. Essential role of non-canonical Wnt signalling in neural crest migration. Development, 132(11): 2587-2597.
• Carpio, R., Honore, S.M., Araya, C., and Mayor, R. 2004. Xenopus paraxis homologue shows novel domains of expression. Developmental Dynamics, 231(3): 609-613.

• Participación en el programa "Ferias científiicas", Explora Los Ríos.
• Participación en programa "Abramos nuestros Laboratorios", Explora Los Ríos.

Equipo de trabajo

• Andrés Rivera, Asistente de Investigación.
• Daniela Carrasco, Técnico en vivero de pez cebra UACh.

Tesistas Pregrado

• Alexis Morales (Bioquímico, UACh)
• Bárbara Ortega (Licenciatura en Ciencias, UACh)
• Luis Cárcamo (Biología Marina, UACh)