José J. Nuñez

Teléfono:+ 56(63)2221483
E-mail: jjnunez@uach.cl/ jjnunezn@gmail.com
Licenciado en Bioquímica, Universidad Austral de Chile (1996).
Bioquímico, Universidad Austral de Chile (1996).
Doctor en Ciencias mención Zoología, Universidad Austral de Chile (2004).
Diplomado en Filosofía de la Ciencia mención Filosofía de los Sistemas Complejos (2019) y Biología (2020), Instituto de Filosofía y Ciencias de la Complejidad. 

Cursos

Pregrado: Zoología (ICML106), Sistemática Molecular (ICML217), Filosofía de la Ciencia (ICML218), Fundamentos de Biología (ICML035), Herpetología (ICML210), Seminarios de Investigación, Tesis.

Postgrado: Sistemática Molecular (ICML320), Sistemática Molecular Avanzada (ICML402), Seminarios Bibliográficos y de Investigación, Tesis.

Programas Complementarios: Desde lo Multi a lo Trans: la Experiencia del Aprendizaje Transdisciplinario (PHAS 125), Ciencia y Poesía (PCCP041).

Intereses de investigación y Educación

a) Sistemática Molecular

b) Biología de Anfibios y Reptiles

c) Educación Sistémica.

Mi principal área de investigación es sobre aspectos de diferenciación genética, origen y especiación de distintos grupos de organismos (moluscos, anfibios y mamíferos).  Estoy particularmente interesado en estudiar los procesos históricos (i.e. geológicos y climáticos) que moldearon la historia evolutiva de las especies de anfibios de la Patagonia, desde un nivel macroevolutivo hasta nivel de poblaciones, analizando tanto marcadores morfológicos, etológicos como moleculares. Como educador, mi objetivo es dar a mis estudiantes las bases para establecer pensamiento crítico. Promuevo en ellos habilidades de identificación y evaluación de explicaciones alternativas para la evidencia que encuentran, aplicando el conocimiento adquirido a nuevas situaciones y comunicando efectivamente estos encuentros a sus pares.

My main research area is about origin, genetic differentiation and speciation of several animal taxa (mollusks, amphibians, and mammals). Our lab is concerned to the study of historical processes (geological, climatic) that shaped the evolutionary history of amphibian and reptiles of Chile, from a macroevolutionary to population perspective using molecular data. As an educator I aim to give to my students the bases to establish communication and critical thinking. I promote in them the habits of identifying and evaluating alternative explanations for the evidence they find, applying the adquired knowledge to new situations and being able to effectively communicate these findings to their peers.

 

Publicaciones (últimos 10 años)

  • Briones, C.; Nuñez, J.J.; Pérez, M.; Garrido, O.; Campos, B.; Godoy, K.; Hartley, R.; Oyarzún, P.A.; Guiñez, R. (2024) Linking Acrosome Size and Genetic Divergence in an Inter-Oceanic Mussel from the Pacific and Atlantic Coasts: A Case of Incipient Speciation? Animals14, 674. https://doi.org/10.3390/ani14050674

  • Suárez-Villota, E.Y., Quercia, C.A., Díaz Camacho, L.M., Valenzuela, J., Nuñez, JJ. (2023)  Mink invasion in Chiloé Island, Chile: population genetics and Leptospira spp. detection in Neovison visonMammalian Research 68, 521–531. https://doi.org/10.1007/s13364-023-00700-7

  • Grosso, J., Barrasso, D.A., Baldo, D., Nuñez, J.J., and Vera Candioti, F. (2022) Developmental diversity in an endemic family of Patagonian frogs (Anura: Batrachylidae), Biological Journal of the Linnean Society, 136, 240-263, https://doi.org/10.1093/biolinnean/blac032

  • Oyarzún, P.A., Toro, J.E., Nuñez, JJ., Suárez-Villota, E.Y. & Gardner, J.P.A. (2021) Blue mussels of the Mytilus edulis species complex from South America: The application of species delimitation models to DNA sequence variation. PLos One, 16(9):e0256961

  • Suárez-Villota, E.Y., Trovatti, E., Contreras, F.A., and Nuñez, JJ. (2021). Characterisation of a skin secretion with adhesive properties in the ground frog Eupsophus vertebralis (Alsodidae). Herpetozoa 34, 169–173.

  • Nuñez JJ, Suárez-Villota EY, Quercia CA, Olivares AP, Sites Jr JW. (2020). Phylogeographic analysis and species distribution modelling of the wood frog Batrachyla leptopus (Batrachylidae) reveal interglacial diversification in south western Patagonia. PeerJ 8:e9980 http://doi.org/10.7717/peerj.9980.

  • Oyarzún PA, Nuñez JJ, Toro JE and Gardner JPA (2020) Trioecy in the Marine Mussel Semimytilus algosus (Mollusca, Bivalvia): Stable Sex Ratios Across 22 Degrees of a Latitudinal Gradient. Frontiers in Marine Sciences. 7:348. doi: 10.3389/fmars.2020.00348.

  • Quercia CA, Suárez-Villota EY, Foresti F, Nuñez JJ (2020) Comparative cytogenetics of the ground frogs Eupsophus emiliopugini Formas, 1989 and E. vertebralis Grandison, 1961 (Alsodidae) with comments on their inter-and intraspecific chromosome differentiation. Comparative Cytogenetics 14(1): 61–74. https://doi.org/10.3897/ CompCytogen.v14i1.46852

  • Kueneman JG, Bletz MC, McKenzie VJ, Becker CG, Joseph MB, Abarca JG, Archer H, Arellano AL, Bataille A, Becker M, Belden LK, Crottini A, Geffers R, Haddad CFB, Harris RN, Holden WM, Hughey M, Jarek M, Kearns PJ, Kerby JL, Kielgast J, Kurabayashi A, Longo AV, Loudon A, Medina D, Nuñez JJ, Perl RGB, Pinto-Tomás A, Rabemananjara FCE, Rebollar EA, Rodríguez A, Rollins-Smith L, Stevenson R, Tebbe CC, Vargas Asensio G, Waldman B, Walke JB, Whitfield SM, Zamudio KR, Zúñiga Chaves I, Woodhams DC, Vences M. (2019). Community richness of amphibian skin bacteria correlates with bioclimate at the global scale. Nature Ecol Evol. 3(3):381-389. doi: 10.1038/s41559-019-0798-1.

  • Suárez-Villota E.Y., Quercia C.A., Díaz L.M., Vera-Sovier V.A. Nuñez J.J. (2018) Speciation in a biodiversity hotspot: phylogenetic relationships, species delimitation, and divergence times of Patagonian ground frogs of the Eupsophus roseus group (Alsodidae). PLoS ONE 13(12): e0204968. DOI: 10.1371/journal.pone.0204968.

  • González, M.T., Z. López, J.J. Nuñez, K.I. Calderón-Mayo, C. Ramírez, D. Morgades, H. Katz, M. George-Nascimento and H. Pavés (2018) Morphometrical and molecular evidence suggests cryptic diversity among hookworms (Nematoda: Uncinaria) that parasitize pinnipeds from the south-eastern Pacific coasts. Journal of Helminthology. Journal of Helminthology 1–9. doi.org/10.1017/S0022149X18000950.

  • Briones, C., J. J. Nuñez, M. Pérez, D, Espinoza-Rojas, C. Molina-Quiroz and R. Guiñez (2018). De novo male gonad transcriptome draft for the marine mussel Perumytilus purpuratus with a focus on its reproductive-related proteins. Journal of Genomics. 6: 127-132.Suarez-Villota, E.Y., C. A. Quercia and J. J. Nuñez (2018). Mitochondrial genomes of the South American frogs Eupsophus vertebralis and E. emiliopugini (Neobatrachia: Alsodidae) and their phylogenetic relationships. Journal of Genomics 6: 98-102.

  • Suárez-Villota, Elkin Y. Camila A. Quercia, J. J. Nuñez, Milton H. Gallardo, Christopher M. Himes, and G. J. Kenagy. (2018).  Monotypic status of the South American relictual marsupial Dromiciops gliroides (Microbiotheria). Journal of Mammalogy, Volume 99, Issue 4, 13 August 2018, Pages 803–812.

  • González, N., Jorge Ruiz, Soledad Puente and J. J. Nuñez (2018). On the status of red-eared slider, Trachemys scripta elegans (Wied, 1838) (Testudines, Emydidae) with evidences of its reproduction in the wild, Chile. Biodiversity International Journal 2(3): 292‒295.

  • Díaz, L, Correa, V. A. and J. J. Nuñez (2018). Molecular evidences of hybridization between Serinus canaria domestica (L., 1758) and Spinus barbatus (Molina, 1782) (Aves: Fringillidae).  Boletín de la Real Sociedad Española de Historia Natural, 112 (1).

  • Martínez, D., R. Oyarzún, C. Vargas-Lagos, J.P. Pontigo, M. Soto-Dávila, J. Saravia, A. Romero,  J.J. Nuñez, A.J. Yáñez,  and L. Vargas-Chacoff (2017). Identification, characterization and modulation of ferritin-H in the sub-Antarctic Notothenioid Eleginops maclovinus challenged with Piscirickettsia salmonis. Developmental and Comparative Immunology 73: 88e96.

  • Parada, D. E., D. Fenolio, A.P. Olivares J. J. Nuñez (2017) Insuetophrynus acarpicus Barrio, 1970 (Anura: Rhinodermatidae): new distribution record at the edge of the Valdivian coastal range, southern Chile. CheckList 13(1): 2034.

  • Grau, J., Nuñez, J.J. Plötner, J., and Poustka, A. (2015). The complete mitochondrial genome of Telmatobufo australis (Amphibia: Anura: Calyptocephalellidae). Mitochondrial DNA. DOI: 10.3109/19401736.2015.1053082.

  • Olivares, A.P., González, N.I., Puente-Torres, S., Contreras-Carrillo, C. & Nuñez, J.J. (2014). Nuevos registros geográfi cos de la rana de pecho espinoso de Cordillera Pelada, Alsodes valdiviensis Formas, Cuevas & Brieva, 2002 (Amphibia: Alsodidae) y evaluación de su estado de conservación. Boletín de Biodiversidad de Chile 9:11-20.

1) Programa Laboratorios Portátiles. Fundación Allende-Connelly-UACh

2) Programa de Indagación Cientifica para la Educación en Ciencias, ICEC. MINEDUC-UACh

3) Valdivian Rain Froglets Initiative, Centro de Humedales Río Cruces.

Estudiantes de Pregrado

  • Fernanda Angulo, Licenciatura en Ciencias, Biología 
  • Millaray Aranda, Licenciatura en Ciencias, Biología
  • Paula Rojas,  Licenciatura en Ciencias, Biología

Estudiantes de Postgrado

  • Camila Quercia, Magister en Ciencias mención Genética (2019)
  • Jorge Machuca, Magister en Ciencias mención Recursos Hídricos (2020)
  • Damián Hernández, Magister en Ciencias mención Genética (2022)

Investigadores Postdoctorales

  • Dr. Carolina Briones (2015-2017)
  • Dr. Elkin Suarez (2016- 2018)
  • Dr. Pablo Oyarzún (2017-2019)
  • Dr. Jimena Grosso (2020- 2023)